189 8069 5689
我们知道R的版本在不停的更新，相应的R包也在不停的更新。我把绘制气泡图和柱形图相关的函数拿出来认真的研究了一下，终于发现的症结所在。
成都创新互联长期为上1000家客户提供的网站建设服务，团队从业经验10年，关注不同地域、不同群体，并针对不同对象提供差异化的产品和服务；打造开放共赢平台，与合作伙伴共同营造健康的互联网生态环境。为柳河企业提供专业的成都网站建设、网站建设，柳河网站改版等技术服务。拥有十多年丰富建站经验和众多成功案例,为您定制开发。
下面给大家介绍一下如何在Windows下对差异基因进行kegg注释。
关键还在于感兴趣点在哪了。粗略的看，可以先看KEGG或者GO功能分类，看差异基因具体富集在哪些通路或功能。比如关注的是细胞内酸合成关键酶，可以重点看酸合成和碳流相关通路。具体如何看KEGG或者GO功能分类，请听下回分解。
可能的原因：Xxx应该是实体类的名字，而不是表的名字。查看hibernate.cfg.xml文件，是否有添加“mapping resource”。
3 GO富集分析 加载了注释库之后，读取基因列表文件，并使用clusterProfiler的内部函数enrichGO()即可完成GO富集分析。读取基因列表文件，并使用clusterProfiler的内部函数enrichKEGG()即可完成KEGG富集分析。
前景基因：指的是我们所要进行富集的基因，一般是基因的ID 背景基因：指的是前景基因在某个基因集合进行富集，这个基因集合就是背景基因 描述信息：每个GO的Term的属性，或者是每个KO号或者map号的属性。
把他设置成100，让我们的标签可以一行展示。是不是还是原来的配方，还是熟悉的味道 同样的柱形图，我们也能让他恢复原来的容貌。
scale_y_discrete则调节label过长的情况，让图片看起来 更美观。3)检查结果，可见geneID展示为gene symbol。（1）在enrichGO函数中，设置readable = TRUE；(2)用setReadable函数，对GO或者KEGG结果进行转化即可。
使用R包GOplot，即可通过给定的数据绘制这种特殊的Venn图，同时展示基因交集以及上下调数量的二维信息。这样这种Venn图组合饼图的样式就得到了。
绘制韦恩图有很多方式，R，Python，Perl等，这里主要是用R来展示；在R语言中，绘制venn图有很多包可以实现：Venn， Vennplot， VennDiagram， VennDetail， ggvenn，gplots等。此文主要展示一下用VennDiagram包绘制高纬度的韦恩图。
接下来，将该文件读到R中，绘制Venn图。VennDiagram包中的函数venn.diagram()，可以直接基于原始数据自动统计并绘制Venn图。工作路径下输出一张图片“vennpng”，打开就是绘制的Venn图。
VennDiagram函数包最大能绘制5个数据集合的韦恩图。