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我不知道你要加什么类型的php代码，我把我想到的告诉给你，希望对你有帮助。
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1、帝国默认都是生成html的，包括首页、分类页、内容页等等。
2、你可以把帝国切换到动态页面(6.0版本)，具体在各栏目的设置中，生成选项，找到对应文件，可以方便切入自已的代码，方法一。
3、系统设置，信息设置，里面有“模板支持程序代码”，你的php代码可以通过模板的方式切入进去，方法二。
4、系统设置，扩展变量，你的php代码内容可以通过系统变量的方式切入，方法三。
第一种 调用的
系统-系统设置-系统参数设置-站点名称
第二种 写在模板里的
直接去首页模板 找到头部修改标题
有图有真相，后台 - 模板 - 管理模板变量（红色框），然后修改右边页面头部（紫色框）。我给你的这个是帝国默认的头部同理，你可以自己调用，自己新增。
帝国默认的模板，导航是自动调用栏目名的，你要自己修改栏目。
如果你要修改首页中间部分的话，就点击蓝色框首页模板修改，修改之后记得一定要刷新，点击数据更新，刷新首页就可以看到你修改的内容了。
看你的问题就知道你不会用CMS的，多去帝国论坛转转，自己多做几次，开源的CMS只要会标签调用没有什么难的。