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武汉测绘科技大学是全国最早开设GIS专业的学校之一，后并入武汉大学。武测的测绘遥感一直是很强大的，亚洲第一，世界第三。相关的其他专业办学成绩也相当不错。不管什么样的排名榜单，武大的GIS总是在最前几位。更多的时候是排第一位的。
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而武大的GIS专业覆盖范围比较广，有制图方向，软件开发方向等。正式的GIS专业属于资源与环境学院，而遥感测绘等学院也有相关的课程。总之，作为武大的王牌学院，遥感测绘资环这三个学院没有垃圾专业，而GIS一般认为是全国最强的。不同的排名可能有不同的评分体系，这个出现些许差别是正常的，但是武大的GIS绝对是一流的，这一点毋庸置疑。
而除了GIS专业，武汉大学的国际软件学院还有一个相关专业，叫空间信息与数字技术，这个专业侧重GIS相关软件的开发，由边馥苓教授，即当年创办武大GIS专业的老教授一手创办。这个专业由于在国内开设的学校很少，而其中有一部分虽然名字相同但是内容不一样，所以算下来全国也就两三所开设这一专业的学校。而在这些学校当中，武大的这一专业无疑是最强的。而且武大这一专业有自己的重点实验室，并且使用卡耐基梅隆大学（全美GIS专业排名第二）的英文原版教材。所以，如果你有意学GIS，那么也可以考虑一下空间信息与数字技术这个专业。
GIS专业的美国三大强校：
加州大学圣塔芭芭拉分校（全美综合排名第42）
GIS牛校，俗称GIS小哈佛，竞争非常激烈，非常难申。该校拥有全美研究水平最高、实验室最多、研究方向最全的地理系。NCGIA三校之一，同时也是GIS界大牛Michael F. Goodchild的大本营，科研经费充裕。该校对申请学生的要求不高，GPA≥3.25、GRE≥1100、 TOEFL 80+，但是每年录取的中国学生都非常少。
纽约州立大学水牛城分校
传统GIS牛校。该校综合排名不高，但GIS相当出名，是NCGIA三校之一。学术会议比较多，研究方向覆盖GIS的诸多研究领域。水牛城的中国人比较多，有好几位做GIS的中国教授，硕士申请难度不大。
缅因大学
NCGIA三校之一。GIS主要侧重CS工程方面，时态空间模型、空间认知。如果有志在GIS方向做出一方成就，并且对纯粹的数学和计算机感兴趣的话，该校是不错的选择。
另外还有宾州州立大学、俄亥俄州立大学、亚利桑那州立大学等在GIS方面都非常出色。其中亚利桑那州立大学对中国学生的认可度较高。
发展前景的话，作为理工研究型交叉学科，地理信息系统专业的竞争相对EE、CS等专业较小。国外目前的GIS研究热点集中在地理信息的分析和表达过程。虽然加拿大是第一个有地理信息系统专业的国家，不过美国的GIS科研水平更高，不管是遥感还是具体的GIS商业应用。近年来国家信息化发展战略把GIS人才的需求推向了前所未有的高度，使得该专业成为为数不多的人才供不应求的热门专业之 一。英国《Nature》也称它为21世纪最有统治力的技术之一。
毕业后学生可以在科研机构或高等学校从事科学研究或教学工作，也可选择在城市、区域、资源、环境、交通、人口、住房、土地、基础设施和规 划管理等领域从事与地理信息系统有关的应用研究、技术开发、生产管理和行政管理等工作，就业范围广阔。
A+
武汉大学，南京师范大学，北京大学
A
北京师范大学，南京大学，中山大学，中国矿业大学，首都师范大学，华东师范大学，浙江大学，东北师范大学
B+
（18个）中国海洋大学，中国农业大学，兰州大学，陕西师范大学，安徽师范大学，中南大学，北京林业大学，山东师范大学，新疆师范大学，广西师范大学，福州大学，同济大学，河南大学，河北师范大学，辽宁师范大学，昆明理工大学，成都理工大学，云南师范大学
B
（17）新疆大学，长江大学，南京农业大学，西南大学，兰州交通大学，河海大学，西北大学，西北师范大学，长安大学，内蒙古师范大学，福建师范大学，四川师范大学，吉林大学，西北农林科技大学，东华理工学院，湖北大学，河南理工大学，安徽科技学院
C
（11个）云南大学，华南农业大学，山西农业大学，西南林学院，江西理工大学，中国人民大学，湖南科技大学，山东可见大学，青海师范大学，西安科技大学，西南交通大学,滁州学院
很多网站都不同的，这个应该有参考价值。我也是今年的应届毕业生，文科生。报了华南农业大学的GIS专业。我想，如果是理科生的话，去武汉大学最好了，它的GIS全国第一（大陆），而且有n个基地班，科研氛围好
个人心目中的排名是
1 武汉大学
2 中科院地理所
3 北京师范大学
4 南京师大、中国地质大
5 北京大学
1在2000年合并了武测，而武测在GIS领域长期处于全国领先的地位，且它的GIS与规划有所结合比较不错，2的情况自不必多说，3虽然在05年学科排名中列了第一，不过我个人觉得北师大比较排外，如果本科不是那里的可能会受歧视，如果你想考北师大建议考研期间去学校里先感受一下，4对基础学科向来重视，5虽然地理学科一级学科在全国排名第一，但是GIS专业的实力远远不及于此。特别是02年遥感所合并到地球与空间科学学院之后更是江河日下。我本科就是在这读的，毕业后转专业了。在北大学习理论和思维方式最为重要，可以培养潜力，但该校GIS学科实力确实不逮。
提问者如果要考研的话，建议先考虑自己本科专业背景，如果不是地理学背景最好不要做GIS理论方向，而且目前GIS理论的前景远远不如应用方向的好。GIS只能作为一种辅助手段，而不能作为主业，除非你想做GIS开发员。其次考虑你考研时注重哪些因素。如果你看重做学问的氛围，建议考中科院、武大；如果你希望在北京，建议考中科院、北师大和北大；如果你看重学校的名气，建议考北大；如果你希望考研时比较容易，建议考北大，拿到几个专业课的讲义，准备好英语和高数就可以了，说来也奇怪，北大GIS初试的专业课向来不难，关键要数学好！如果想看PPMM，不妨考虑北师大和地质大（最后一句玩笑了：）
我能提供的情况就这样，希望有所帮助！其他请后来回答者补充指正。