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第一步：用Xshell登陆服务器，cd命令进入你要存放R.tar.gz压缩包的路径，如第一张图，我是cd ~/software，进入~/software路径才开始下载R压缩包。然后wget +url（R文件网址）获取R-0.0.tar.gz。
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R #在命令行直接输入“R”即可进入R 编辑。
安装就先不说了，挺简单的。安装完成后输入rstudio-server可以看到相应的指令。为了激活，我们输入rstudio-server start，就已经激活了。但要在网页端打开，我们还要知道ip是多少。
打开系统，找到软件中心，打开软件中心。如下图所示。在这里可以安装一些软件，但是软件比较少。如下图所示。或者直接从网站上下好deb的安装包，然后双击进行安装。如下图所示。最后，双击软件后点击安装即可。
如何在Linux下安装软件，我说几个方法：使用rpm类型的软件包进行安装，虽然排在最前面但是我也不推荐新手使用，因为所依赖的包会很多。
使用rpm类型的软件包进行安装，虽然排在最前面但是我也不推荐新手使用，因为所依赖的包会很多。从guan 网下载rpm软件包，直接通过命令 rpm-ivh软件包名 如果是阿里云服务器可以使用命令。
RPM全称是RedHatPackageManager（RedHat包管理器）。RPM本质上就是一个包，包含可以立即在特定机器体系结构上安装和运行的Linux软件。RPM示意图见图1。
软件安装命令 apt-get ，yum， cat -n等。 常用表达式 ！， ！$， {a..b}，{a，b，c}，{$1-$9}，$0， $#，$？，$$，$*等。
linux常用命令： pwd命令 该命令的英文解释为print working directory(打印工作目录)。输入pwd命令，Linux会输出当前目录。 cd命令 cd命令用来改变所在目录。
Linux下主要有两种方式，主要分在线安装和线下安装。（以下介绍的方式基本涵盖所有Linux系统的软件安装方式）在线安装 软件管理中心安装。
aptitude——详细查看已安装或可用的软件包。与apt-get类似，aptitude可以通过命令行方式调用，但仅限于某些命令——最常见的有安装和卸载命令。由于aptitude比apt-get了解更多信息，可以说它更适合用来进行安装和卸载。
1、执行jar包的命令和在windows操作系统上是一样的，都是java -jar xxxx.jar。将jar程序设置成后台运行，并且将标准输出的日志重定向至文件consoleMsg.log。
2、linux解压jar包命令——jar命令详解jar命令选项：jar命令格式：jar{ctxuf}[vme0Mi][-C目录]文件名...其中{ctxu}这四个选项必须选其一。[vfme0Mi]是可选选项，文件名也是必须的。
3、首先基本的运行 jar 包命令如下 这个命令会锁定命令窗口，当窗口关闭时，程序也就自动退出了，所以需要让 jar 包后台运行。
4、当需要把在Windows上开发的Java程序用在Linux上运行时，就需要吧该Java程序打包成jar包上传到Linux上去运行。
把iso写到U盘极可能不能引导成功。从guan 网下载iso（约600多M）。在linux下用一条dd指令即可。
使用包管理器安装。在Debian或Ubuntu上可以使用apt-get，在Fedora上可以使用yum等。
可以通过本参数来进行修改，来选择安装的文件夹。本地来安装如果你已经下载的相应的包的压缩文件，则可以在本地来进行安装。
安装R包（seqinr）时遇到以下问题（缺少config文件）：从报错信息可以看出报错根本原因是找不到zlib.h 1，确认是否安装zlib 注：上述命令Linux下运行，而非R环境下运行 输出结果：可见zlib已安装。
Linux常用安装包及安装方法安装包一般有四类： 1）tar包，如software-3-tar.gz。他是使用UNIX系统的打包工具tar打包的。 2）rpm包，如software-3-i38rpm。