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要清账的话，首先你被清账的科目得有设置未清项标识，有此标识的科目才能进行清账。
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你用FS00 查看你下你的科目数据上“未清项管理”是否已经被打上勾了。
如果是总账科目清账 你先尝试用用F.13 自动清账，看看是否能完成清账。
如果是供应商的清账，使用F-44 。
如果是客户的清账，使用F-32。
至于选择清账的方式，是部分清账，还是剩余清账，就看你们公司的规定选择。
具体的操作我相信你们肯定有操作手册的，看看你们公司的操作手册吧。
除了楼上说的做BAPI批量处理外，还有两种方法可以处理：
一、事务码MEMASSPO批量维护采购订单：
1、先选择“表”视图的采购订单行项目；
2、再在“字段”视图选择MASSEKPO-ELIKZ交货已完成、MASSEKPO-EREKZ最后发票两个字段；
3、执行后再选择采购订单号（若不清楚具体的可以输入一个采购订单号范围）；
4、执行后，将交货已完成标识为是的筛选出来，再批量更新最后发票字段（打勾即可）。
二、用LSMW做一个批处理：先做好录屏，再整理模板，再批量导入。
SAP中部分收款和剩余收款有两种方法：一为"部分支付"方法，一为"剩余项目"方法。
一、部分支付方法.
点击"处理未清项"界面中的"部分支付"选项卡,将光标放在"支付金额"栏,双击可发现系统自动将收款金额更新至此支付金额,同时,界面右下角的"已分配金额"="输入金额",此时再去做凭证"模拟",可发现系统预制一张凭证:
借:银行存款或现金科目
贷:客户账号(双击可查看此客户账号对应的总账科目)
保存过账.退出.
点击菜单"凭证-模拟".系统预制一张凭证:
借:银行存款或现金科目
贷:客户账号(双击可查看此客户账号对应的总账科目)
保存过账.退出.
二、剩余项目方法.
点击"处理未清项"界面中的"剩余项目"选项卡,将光标放在"剩余项目"栏,双击可发现系统自动将原发票金额与本次输入金额的差额纪录再次,同时,界面右下角的"已分配金额"="输入金额",此时再去做凭证"模拟",可发现系统预制一张凭证:
借:银行存款或现金科目
客户账号(双击进入该会计凭证行的明细信息,反映了剩余款项的付款条件情况)(即本次还款与发票的差额)
贷:客户账号(双击可查看此客户账号对应的总账科目)
保存过账.退出
点击菜单"凭证-模拟".系统预制一张凭证:
借:银行存款或现金科目
贷:客户账号(双击可查看此客户账号对应的总账科目)
保存过账,退出.
此时再通过FD10N去查看该客户账户余额,可发现关于该发票的所有项目已经结清.
两种方法的区别：:
1.部分支付法与剩余项目法都能完成对发票的结清,实现的功能是一样的,但表现方式不一样,或者说是在该项目未全清之前,我们付款所看到的东西不一样。
2.部分支付法是暂时不将原来的发票做清账,而另外产生一笔金额为负的未清科目,两个未清科目的和才是真正还需向客户收款的金额。
而剩余项目法是在第一次收款时就已将原来的发票做清账,而同时又产生另外一个未清项目,新产生的未清项目金额即是客户还未付款的金额。
3.部分支付不更改原行项目的帐期。
剩余金额法新产生的余额项目的帐期要重新开始计算。