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还在。源代码是一种用某种计算机语言编写的程序，由汇编器和编译器翻译成目标码，删除后软件还在，软件是一系列按照特定顺序组织的计算机数据和指令的集合。
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如果是svn共享的话，就使用team更新应该就会复原了。如果是手误在没有关掉java文件的情况下使用ctrl+z就可以还原吧。
你看看在不在回收站里，如果也清空了，你就重新去java官网下载一个来安装，路径记得选和原来一样的位置，如果位置不一样，你其他要用到java的软件就要重新配环境。