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原因很多，有可能是程序问题，也可能是访问量太大，也可能是服务器配置太低，这个可以升级的。
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原因有很多的。
主键约束。
当数据量达到百万以上的时候，你用主键去搜索某一条数据时速度是极快的。但当你不用主键去搜索的时候速度就降了几十倍甚至上百倍，这个是主键的好处。
索引。
当你的表字段设置有索引的时候，搜索速度比不创建索引要快几倍至几十倍。
sql语句不够优化。
在查询某数据的时候，能不用*就尽量不用，想要哪个字段就查哪个，多余的不要，这样就能达到数据传输精简化，让查询速度也能快上许多。
多表联合查询。
在大数据量的时候这个多表查询尽量不用，毕竟是很耗内存的，宁愿用其他语言循环执行简单的 select 字段 from 表名 where 条件 这样的简单sql语句，这样也能加快速度。
既然网速已经测试过了是正常的，则说明使用阿里云服务器有问题就是其他原因了，大体有如下几种，登录的服务器与自己的宽带不是同一运营商，这属于运营商之间的网络瓶颈，只能更换同一运营商的服务器。另外还可能此服务器端口速率过低或者处理能力不行造成的。
1、一般情况下，请先检查您服务器的使用情况。您的服务器配置跟不上您用户增长的速度，需要扩展服务器的配置才导致您的服务器比较卡。CPU使用率是否大于50%、网络使用率是否过高、内存使用率是否过高，如果出现上述情况，则表明您的服务器或网络无法承载您目前的服务，请联系服务商调整您的资源，及时扩容。
2、服务器遭遇DDoS攻击导致，服务器自然会呈现出慢的假象，如果不及时防护，有可能我们的网站会出于瘫痪。需要联系服务商售后人员做DDoS防护策略。
3、服务器遭遇较大的流量攻击，但服务器没有被流量牵引。
4、机房网络故障，这将是大范围的故障。
5、设备网卡故障、网线故障、上层交换机故障。在出现故障前，您可以对您服务器的相邻ip进行测试，如果相邻ip也同样出现丢包情况，说明是上层交换设备故障。