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你是不是安装过mysql的其它版本？如果是，要卸载，而且卸载之前要先停止系统进程里的mysql服务，再重启，再安装新的版本才行。
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目前给你提供一点解决办法供参考
1。打开系统服务进程：右击我的电脑-管理-服务和应用程序-服务，找到mysql，包括老版本和新版本的，右击，全部停用
2。卸载已经安装的MySQL4.1
3。重启，手动全部删除旧的安装文件夹，尤其是windows\my.ini
4。再去看看服务进程里有没有mysql，如果有，右击-属性-启动类型-禁用
5。安装新的版本，最好改变安装路径。等到出现选择启动win服务的下拉框时候，选41的那个就应该能成功了。
有两种启动方式
1.Win+R+cmd:启动运行，打开命令行；mysql -h127.0.0.1 -uroot -proot。
2.直接找到软件文件夹打开。
大致使用步骤
1首先要先建数据库，使用数据库；create database 数据库名;use 数据库名;
2再创建表，插入数值；create table 表名(字段名1 类型 其他，字段名2类型 其他.....)
3然后就可以进行其他操作；
方法一：控制面板-管理工具-服务，停止你的MYSQL4.0,再启动5.0就行了
方法二：如果你想要两个版本共存，找到文件夹下的my.ini文件，里面有端口的设置，5.0的你改成
port=6612
默认应该是：3306，这个端口就给你的4.0用吧
修改端口后，启动5.0即可