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php大马的作用不包括反弹shell反向链接。根据查询相关资料显示php大马就是php写的提取站点权限的程序，包括恶意命令执行、文件删除、新建文件、数据库增删改查等等，唯独不包括反向链接。大马指木马病毒，带有提权或者修改站点功能，因此称为木马。
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大马：指木马病毒；
php大马，就是php写的提取站点权限的程序；因为带有提权或者修改站点功能，所以称为叫木马；
查看已有的安全措施还真没什么好想法，最多看看php.ini是否开了magic_quote，safe_mode之类的（慎重开启）。还有各文件夹权限。一些比如doc_root,之类的apache设置php本身并不能查看。以及是否安装使用ssl。
至于安全措施那可太多了。简要说几点最实用的：
一些apache服务器安全配置我就不说了，网上很容易就能找出一堆，其实
在服务器管理主要有一个基本原则就是分好文件夹，能执行php的文件夹绝不给写入权，能写入的文件夹绝不能给php执行权。
数据库管理中严格规定好数据库用户的权限，通常安装好网站之后只给它某些表的delete，update，select，insert权限，但有些用视图和索引存储过程的表要注意放权。
在程序员能够控制的范围主要是防注入和xss，以及一些syetem，exec语句的防篡改。
对于sql注入，主要是对存入数据库的变量addslashes().（数据库是gbk编码时有漏洞）同时注意拼接字符串时候一定要给变量用单引号'围起来如select * from user where name='$name'
对于xss，主要是清除特殊标签和属性，或者完全去除html标签，通常用正则去掉特殊标签，用strip_tags全部去除html（不大实用，最好还是正则去除），还有就是替换"'成html编码。
对于system等shell防范：如果根本用不着这些危险的语句，管理员可以直接在php.ini 的disable_functions里添加名单，屏蔽掉，如果有使用，在接收外部语句的时候要使用escapeshellarg()来包围篡改语句。
当然这里只是抛砖引玉，具体更多，百度php安全防范，php安全编程
最基本的：
文件管理，命令执行，数据库连接
其他都是无所谓。